Колокола Нагасаки

После победы над Петельгейзе Романе-Конти, Субару Нацуки рассчитывает на период затишья и встречу с Эмилией. Однако по дороге на повозку, в которой находятся Рем и Круш, совершается нападение. Атакуют двое членов Культа Ведьмы, в результате чего обе девушки теряют сознание и память. Кроме того, сам факт существования Рем стирается из воспоминаний всех окружающих, кроме самого Субару.

Столкнувшись с новой угрозой, Субару вынужден вновь анализировать ситуацию. Он осознаёт, что конфликт с культом не исчерпан, а его способность возвращаться после смерти к определённой точке может быть единственным преимуществом. Основной задачей становится защита Эмилии и своих союзников, которые не помнят о произошедшем нападении и связанных с ним опасностях.

Сюжет развивается вокруг попыток Субару предотвратить новые атаки культистов, сохранив при этом жизни своих друзей. Ему предстоит разобраться в мотивах и планах Культа Ведьмы, одновременно пытаясь найти способ восстановить память Рем и Круш. Ситуация осложняется тем, что Субару действует в условиях информационного вакуума, так как остальные персонажи не обладают знаниями о предыдущих событиях.